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如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)

时间:2023-05-28 作者: 小编 阅读量: 1 栏目名: 星座百科

今天就给大家介绍一个工具:PubReminer这个工具是一个Pubmed资料分析工具,不仅可以汇总分析PubMed查询结果提高查询效率,另外还可以为论文选择可投期刊,查找某一研究领域的专家,并且还可以确定某一专家的研究方向。在作者一栏还可以看到发表文献最多的作者是ZHANGJ,如果想了解一下这位作者的全部研究,勾选后点击SearchAgain,只看其研究,然后可以点击GotoPubmedwithquery回到PubMed看到作者所有发表的相关文献。

Pubmed 是我们最常用的检索数据库,很多小伙伴都会用,但是能不能用好又是另外一回事了,当你用 Pubmed 进行检索的时候,可能会得到很多文献,上千上万篇的文献到底哪些是自己需要的呢?

我们常规的方法是通过增加或变化检索词、限制检索条件来进行筛选,但是到底改变哪些检索词更有效可能很多人不清楚。

今天就给大家介绍一个工具:PubReminer

这个工具是一个 Pubmed 资料分析工具,不仅可以汇总分析 PubMed 查询结果提高查询效率,另外还可以为论文选择可投期刊查找某一研究领域的专家,并且还可以确定某一专家的研究方向

下面跟我一起来体验下这个工具吧:

官方网址:

https://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi

PubReminer 的检索区域包括:检索输入框、条件限制、检索结果显示数量和基因检索。可以在检索框中直接输入检索式,如果不会自己写,你可以利用 PubMed 的高级检索方法,把最后得到的检索式 Copy 到 PubReminer 中就行了。

下面举个例子

比如我们想找下冠状病毒治疗的相关文献,我们在 Pubmed 高级检索中得到下面方框中的检索式。

我们把这个检索式 copy 到 PubReminer 中

因为我们在 Pubmed 中已经知道有 928 篇文献,所以显示检索数量可以不修改你,默认就是最多显示 1000 篇,如果你检索的结果超过了 1000 篇,可以在这里修改显示数量,最多不能超过 10000 篇。

我们点击 Start PubReMiner,开始会有一个等待的过程,网站需要花一点时间去分析处理,等待时间有个红框显示。

分析完成后我们可以看到下面的结果,把文献按照不同的条件进行了分类,如年代、杂志、作者、关键词、主题词、物质、发表形式,每一组都按照降序排列。

如果不想显示某些条件分析的结果,可以在右边把某些分类的勾去掉,然后点击 Search with Manual Adjustment

通过上面的结果,我们可以看到发表杂志最多的是 Journal of Virology。

此时可以选择相应的限制条件,如选中某些期刊,或者还可以加上某些作者,或者加上一些关键词(Word),通过 Operator 下拉列表中的 AND 还是 NOT 增加检索词或者排除某些结果,这样可以更能缩小检索结果,比 PubMed 更直观、有效。

比如这个例子我只想看前 2 个杂志的文章,那么勾选前面 2 个杂志,Operator 选择 AND,点击 Search Again

点击后就会只显示这 2 个杂志的文献分析结果,我们可以放心检索框中的检索式已经改变,点击 Goto Pubmed with query 我们会回到 Pubmed 的界面。

我们在投稿时有些杂志要求作者提供审稿人,可以根据 PubReMiner 的检索结果进行查找相关的专家。在作者一栏还可以看到发表文献最多的作者是 ZHANG J,如果想了解一下这位作者的全部研究,勾选后点击 Search Again,只看其研究,然后可以点击 Goto Pubmed with query 回到 PubMed 看到作者所有发表的相关文献。

除了检索文献,PubReminer 还可以检索基因,但是有时候比较卡,可能会出现白屏打不开的情况,你们可以自己试试。

总的来说 PubReminer 是一个不错的分析工具,总结有以下几个优点:

1. 帮助我们快速筛选 Pubmed 得到的结果,通过各种分类缩小范围满足我们的需要;

2. 可以快速掌握一个领域的研究趋势,根据发表年代的文献数量,看出这方面的研究是增加还是在减少,以此确定你的方向是不是研究热点,简直是开题神器;

3. 根据得到的杂志排名,找到发表此类文献最多的期刊,我们投稿的时候可以选择这些期刊;

4. 根据作者信息,可以找到此类研究最多的大牛是谁,如果想外出深造,当然首选此类大牛,出研究成果的机率也就大大的增加;

5. 免费的,随便用,这个是关键。

文章来源:逍遥君自习室

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